Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
4930444P10RikD3YUR1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms