Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm17333C6EQI3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm17333C6EQI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms