Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms