Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms