Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
1700018F24RikB2RW27 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
1700018F24RikB2RW27 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms