Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prrt4B2RU40 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms