Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Spocd1B1ASB6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spocd1B1ASB6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms