Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem238A9JSM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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