Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930435E12RikA6X8Z9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4930435E12RikA6X8Z9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms