Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp4A4UUI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gbp4A4UUI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms