Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Prr16A3KMN5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Prr16A3KMN5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Prr16A3KMN5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Prr16A3KMN5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prr16A3KMN5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Prr16A3KMN5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prr16A3KMN5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms