Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Odf2A3KGV1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms