Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Plcb2A3KGF7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Plcb2A3KGF7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plcb2A3KGF7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Plcb2A3KGF7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms