Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CatsperbA2RTF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms