Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra4A2RT60 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra4A2RT60 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms