Protein–RNA interactions for Protein: A2CG71

Btbd35f19, BTB domain-containing 35, family member 19, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f19A2CG71 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Btbd35f19A2CG71 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Btbd35f19A2CG71 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms