Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtcflA2APF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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