Protein–RNA interactions for Protein: A2AI08

Tprn, Taperin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprnA2AI08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TprnA2AI08 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TprnA2AI08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms