Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Frmpd4A2AFR3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms