Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef6A2A8M8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef6A2A8M8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms