Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fam71e1A1L3C1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam71e1A1L3C1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms