Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc173A0JLY1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms