Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms