Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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