Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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