Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Usp27Q8CEG8 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp27Q8CEG8 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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