Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Lrrtm2Q8BGA3 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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