Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Usp49Q6P9L4 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms