Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc18Q640L5 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc18Q640L5 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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