Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp39Q3TIX9 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp39Q3TIX9 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp39Q3TIX9 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp39Q3TIX9 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Usp39Q3TIX9 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp39Q3TIX9 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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