Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Sh3bp1P55194 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Sh3bp1P55194 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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