Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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