Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtprsB0V2N1 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtprsB0V2N1 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PtprsB0V2N1 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PtprsB0V2N1 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtprsB0V2N1 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PtprsB0V2N1 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PtprsB0V2N1 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PtprsB0V2N1 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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