Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Usp48Q3V0C5 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms