Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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Traf3ip1Q149C2 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Traf3ip1Q149C2 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms