Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp4P35123 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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