Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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