Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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