Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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