Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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