Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ercc8Q8CFD5 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms