Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp27Q8CEG8 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp27Q8CEG8 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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