Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NcanP55066 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NcanP55066 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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