Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
RxrgP28705 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
RxrgP28705 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms