Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms