Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Ccdc71Q8VEG0 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Ccdc71Q8VEG0 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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