Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms