Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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Hoxd13P70217 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms