Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Kif3aP28741 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms