Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
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